Вычислительные методы для системной биологии
ФРОНТИРНЫЕ ЛАБОРАТОРИИ
РУКОВОДИТЕЛЬ ПРОЕКТА
ЦЕЛЬ ПРОЕКТА
Разработка коллекции открытых, эффективных и удобных вычислительных методов и программных инструментов, помогающих получать результаты на переднем крае биологии, с фокусом на иммунологию, данные об экспрессии генов и графовые алгоритмы.
КЛЮЧЕВЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ
- Фреймворк для сетевых методов интерпретации биологических данных, применимый для разных типов биологических сетей и типов данных.
- Веб-сервисы для работы с открытыми экспериментальными транскриптомными данными, интегрирующие разработанные в лаборатории вычислительные методы анализа.
- Алгоритмы и программные инструменты для комбинаторной оптимизации и сэмплирования, с фокусом на графы.
ЯДРО КОМАНДЫ
- Лобода Александр Александровичассистент, факультет информационных технологий и программирования
руководитель проекта - Сергушичев Алексей Александровичдиректор, научно-образовательный центр геномного разнообразия
научный руководитель проекта
- Алексеев Никита Владимировичдоцент, факультет информационных технологий и программирования
разработка новых алгоритмических подходов к решению биоинформатических задач
- Зайцев Константин Вячеславовичаспирант 3-го года, факультет информационных технологий и программирования
разработка методов и веб-сервисов для работы с данными транскриптомики единичных клеток - Сухов Владимир Дмитриевичаспирант 4-го года, факультет информационных технологий и программирования
разработка статистических методов интерпретации транскриптомных данных